Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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