Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms