Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nop56Q9D6Z1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nop56Q9D6Z1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nop56Q9D6Z1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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