Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms