Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn4Q9D6I3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms