Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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