Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms