Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms