Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms