Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fndc8Q9D2H8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc8Q9D2H8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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