Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Trappc6bQ9D289 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Trappc6bQ9D289 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Trappc6bQ9D289 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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