Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms