Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx17Q9D0I4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms