Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms