Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp11Q9CZJ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms