Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms