Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtpbp8Q9CY28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms