Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CXL3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CXL3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms