Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed5Q9CXE7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms