Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms