Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms