Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smurf1Q9CUN6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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