Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms