Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cox16Q9CR63 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox16Q9CR63 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms