Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms