Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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