Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Chchd5Q9CQP3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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