Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms