Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ergic3Q9CQE7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ergic3Q9CQE7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ergic3Q9CQE7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ergic3Q9CQE7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ergic3Q9CQE7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic3Q9CQE7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms