Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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