Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab27bQ99P58 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab27bQ99P58 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab27bQ99P58 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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