Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms