Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms