Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms