Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms