Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms