Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms