Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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