Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZE0

Tmlhe, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmlheQ91ZE0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TmlheQ91ZE0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TmlheQ91ZE0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms