Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms