Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm2Q91YD4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm2Q91YD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms