Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms