Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh10Q8VCH7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh10Q8VCH7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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