Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln1Q8R317 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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