Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r22Q8R2D1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r22Q8R2D1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms