Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccm2Q8K2Y9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms