Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms