Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms