Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwnkQ8CIW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms