Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab43Q8CG50 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms